Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LYVE1Q9Y5Y7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms