Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2IRD1Q9UHL9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2IRD1Q9UHL9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms