Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CHD7Q9P2D1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHD7Q9P2D1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHD7Q9P2D1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHD7Q9P2D1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CHD7Q9P2D1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHD7Q9P2D1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHD7Q9P2D1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHD7Q9P2D1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHD7Q9P2D1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHD7Q9P2D1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHD7Q9P2D1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHD7Q9P2D1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHD7Q9P2D1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHD7Q9P2D1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHD7Q9P2D1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHD7Q9P2D1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHD7Q9P2D1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHD7Q9P2D1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHD7Q9P2D1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHD7Q9P2D1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHD7Q9P2D1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHD7Q9P2D1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHD7Q9P2D1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHD7Q9P2D1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHD7Q9P2D1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHD7Q9P2D1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHD7Q9P2D1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHD7Q9P2D1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHD7Q9P2D1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHD7Q9P2D1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHD7Q9P2D1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHD7Q9P2D1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms