Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0K8

FOXJ2, Forkhead box protein J2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXJ2Q9P0K8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXJ2Q9P0K8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXJ2Q9P0K8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXJ2Q9P0K8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXJ2Q9P0K8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXJ2Q9P0K8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXJ2Q9P0K8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXJ2Q9P0K8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXJ2Q9P0K8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXJ2Q9P0K8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXJ2Q9P0K8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXJ2Q9P0K8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXJ2Q9P0K8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXJ2Q9P0K8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXJ2Q9P0K8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXJ2Q9P0K8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXJ2Q9P0K8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXJ2Q9P0K8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXJ2Q9P0K8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXJ2Q9P0K8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms