Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYM8

RBCK1, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBCK1Q9BYM8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBCK1Q9BYM8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBCK1Q9BYM8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms