Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNHG12Q9BXW3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms