Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SYCP2Q9BX26 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SYCP2Q9BX26 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SYCP2Q9BX26 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SYCP2Q9BX26 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SYCP2Q9BX26 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SYCP2Q9BX26 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SYCP2Q9BX26 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SYCP2Q9BX26 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SYCP2Q9BX26 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SYCP2Q9BX26 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SYCP2Q9BX26 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SYCP2Q9BX26 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SYCP2Q9BX26 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SYCP2Q9BX26 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SYCP2Q9BX26 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SYCP2Q9BX26 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SYCP2Q9BX26 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
SYCP2Q9BX26 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SYCP2Q9BX26 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SYCP2Q9BX26 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SYCP2Q9BX26 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SYCP2Q9BX26 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SYCP2Q9BX26 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SYCP2Q9BX26 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
SYCP2Q9BX26 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SYCP2Q9BX26 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
SYCP2Q9BX26 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
SYCP2Q9BX26 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SYCP2Q9BX26 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SYCP2Q9BX26 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SYCP2Q9BX26 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SYCP2Q9BX26 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SYCP2Q9BX26 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SYCP2Q9BX26 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SYCP2Q9BX26 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SYCP2Q9BX26 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SYCP2Q9BX26 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SYCP2Q9BX26 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SYCP2Q9BX26 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SYCP2Q9BX26 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SYCP2Q9BX26 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SYCP2Q9BX26 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SYCP2Q9BX26 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SYCP2Q9BX26 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SYCP2Q9BX26 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SYCP2Q9BX26 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SYCP2Q9BX26 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SYCP2Q9BX26 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SYCP2Q9BX26 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SYCP2Q9BX26 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SYCP2Q9BX26 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
SYCP2Q9BX26 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SYCP2Q9BX26 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SYCP2Q9BX26 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SYCP2Q9BX26 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SYCP2Q9BX26 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
SYCP2Q9BX26 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SYCP2Q9BX26 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SYCP2Q9BX26 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SYCP2Q9BX26 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SYCP2Q9BX26 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SYCP2Q9BX26 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SYCP2Q9BX26 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SYCP2Q9BX26 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SYCP2Q9BX26 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SYCP2Q9BX26 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SYCP2Q9BX26 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SYCP2Q9BX26 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SYCP2Q9BX26 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms