Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE4

SELENOS, Selenoprotein S, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOSQ9BQE4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SELENOSQ9BQE4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SELENOSQ9BQE4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SELENOSQ9BQE4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SELENOSQ9BQE4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SELENOSQ9BQE4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SELENOSQ9BQE4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SELENOSQ9BQE4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SELENOSQ9BQE4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SELENOSQ9BQE4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SELENOSQ9BQE4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SELENOSQ9BQE4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SELENOSQ9BQE4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SELENOSQ9BQE4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SELENOSQ9BQE4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SELENOSQ9BQE4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SELENOSQ9BQE4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SELENOSQ9BQE4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SELENOSQ9BQE4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SELENOSQ9BQE4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SELENOSQ9BQE4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SELENOSQ9BQE4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms