Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYNGAP1Q96PV0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYNGAP1Q96PV0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNGAP1Q96PV0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNGAP1Q96PV0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNGAP1Q96PV0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNGAP1Q96PV0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNGAP1Q96PV0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNGAP1Q96PV0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNGAP1Q96PV0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNGAP1Q96PV0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNGAP1Q96PV0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNGAP1Q96PV0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNGAP1Q96PV0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNGAP1Q96PV0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNGAP1Q96PV0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNGAP1Q96PV0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNGAP1Q96PV0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNGAP1Q96PV0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNGAP1Q96PV0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNGAP1Q96PV0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNGAP1Q96PV0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNGAP1Q96PV0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms