Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF558Q96NG5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF558Q96NG5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF558Q96NG5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF558Q96NG5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF558Q96NG5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF558Q96NG5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF558Q96NG5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF558Q96NG5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF558Q96NG5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF558Q96NG5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF558Q96NG5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF558Q96NG5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF558Q96NG5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF558Q96NG5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF558Q96NG5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF558Q96NG5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF558Q96NG5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF558Q96NG5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF558Q96NG5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF558Q96NG5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF558Q96NG5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF558Q96NG5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF558Q96NG5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF558Q96NG5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms