Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms