Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLMNQ96JQ2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLMNQ96JQ2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CLMNQ96JQ2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms