Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
COG3Q96JB2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
COG3Q96JB2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
COG3Q96JB2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
COG3Q96JB2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
COG3Q96JB2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
COG3Q96JB2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
COG3Q96JB2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
COG3Q96JB2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
COG3Q96JB2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
COG3Q96JB2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
COG3Q96JB2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
COG3Q96JB2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
COG3Q96JB2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
COG3Q96JB2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
COG3Q96JB2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
COG3Q96JB2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
COG3Q96JB2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
COG3Q96JB2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
COG3Q96JB2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
COG3Q96JB2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
COG3Q96JB2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
COG3Q96JB2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
COG3Q96JB2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
COG3Q96JB2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
COG3Q96JB2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
COG3Q96JB2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
COG3Q96JB2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
COG3Q96JB2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
COG3Q96JB2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
COG3Q96JB2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
COG3Q96JB2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
COG3Q96JB2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
COG3Q96JB2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
COG3Q96JB2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms