Protein–RNA interactions for Protein: Q96HC4

PDLIM5, PDZ and LIM domain protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM5Q96HC4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDLIM5Q96HC4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDLIM5Q96HC4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDLIM5Q96HC4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDLIM5Q96HC4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDLIM5Q96HC4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDLIM5Q96HC4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDLIM5Q96HC4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDLIM5Q96HC4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDLIM5Q96HC4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDLIM5Q96HC4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDLIM5Q96HC4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDLIM5Q96HC4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDLIM5Q96HC4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDLIM5Q96HC4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDLIM5Q96HC4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDLIM5Q96HC4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDLIM5Q96HC4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDLIM5Q96HC4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDLIM5Q96HC4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDLIM5Q96HC4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDLIM5Q96HC4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDLIM5Q96HC4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDLIM5Q96HC4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms