Protein–RNA interactions for Protein: Q96F44

TRIM11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM11Q96F44 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM11Q96F44 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM11Q96F44 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM11Q96F44 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM11Q96F44 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM11Q96F44 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM11Q96F44 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM11Q96F44 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM11Q96F44 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM11Q96F44 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM11Q96F44 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM11Q96F44 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM11Q96F44 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM11Q96F44 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM11Q96F44 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM11Q96F44 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM11Q96F44 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM11Q96F44 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM11Q96F44 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM11Q96F44 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM11Q96F44 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM11Q96F44 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM11Q96F44 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM11Q96F44 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM11Q96F44 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM11Q96F44 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM11Q96F44 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM11Q96F44 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM11Q96F44 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM11Q96F44 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM11Q96F44 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM11Q96F44 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM11Q96F44 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM11Q96F44 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM11Q96F44 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM11Q96F44 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM11Q96F44 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM11Q96F44 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM11Q96F44 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM11Q96F44 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM11Q96F44 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM11Q96F44 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM11Q96F44 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM11Q96F44 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM11Q96F44 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM11Q96F44 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM11Q96F44 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM11Q96F44 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM11Q96F44 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM11Q96F44 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM11Q96F44 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM11Q96F44 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM11Q96F44 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM11Q96F44 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM11Q96F44 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM11Q96F44 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM11Q96F44 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM11Q96F44 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM11Q96F44 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM11Q96F44 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM11Q96F44 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms