Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PGBD4Q96DM1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PGBD4Q96DM1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGBD4Q96DM1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms