Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATRIPQ8WXE1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATRIPQ8WXE1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms