Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY3

ACTRT2, Actin-related protein T2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT2Q8TDY3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTRT2Q8TDY3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTRT2Q8TDY3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms