Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNLDC1Q8NA58 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms