Protein–RNA interactions for Protein: Q86UV7

TRIM73, Tripartite motif-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM73Q86UV7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms