Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CCDC141Q6ZP82 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CCDC141Q6ZP82 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CCDC141Q6ZP82 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CCDC141Q6ZP82 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CCDC141Q6ZP82 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CCDC141Q6ZP82 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CCDC141Q6ZP82 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CCDC141Q6ZP82 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CCDC141Q6ZP82 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC141Q6ZP82 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC141Q6ZP82 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC141Q6ZP82 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC141Q6ZP82 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CCDC141Q6ZP82 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CCDC141Q6ZP82 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CCDC141Q6ZP82 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CCDC141Q6ZP82 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CCDC141Q6ZP82 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CCDC141Q6ZP82 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
CCDC141Q6ZP82 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC36.32■■■■□ 3.41
CCDC141Q6ZP82 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CCDC141Q6ZP82 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CCDC141Q6ZP82 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CCDC141Q6ZP82 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC141Q6ZP82 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC141Q6ZP82 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC141Q6ZP82 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC141Q6ZP82 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC141Q6ZP82 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC141Q6ZP82 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC141Q6ZP82 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC141Q6ZP82 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC141Q6ZP82 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CCDC141Q6ZP82 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CCDC141Q6ZP82 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CCDC141Q6ZP82 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CCDC141Q6ZP82 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CCDC141Q6ZP82 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CCDC141Q6ZP82 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CCDC141Q6ZP82 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CCDC141Q6ZP82 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CCDC141Q6ZP82 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CCDC141Q6ZP82 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC141Q6ZP82 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC141Q6ZP82 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC141Q6ZP82 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC141Q6ZP82 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC141Q6ZP82 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC141Q6ZP82 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC141Q6ZP82 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC141Q6ZP82 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC141Q6ZP82 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC141Q6ZP82 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CCDC141Q6ZP82 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CCDC141Q6ZP82 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CCDC141Q6ZP82 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CCDC141Q6ZP82 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CCDC141Q6ZP82 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CCDC141Q6ZP82 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CCDC141Q6ZP82 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CCDC141Q6ZP82 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
CCDC141Q6ZP82 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CCDC141Q6ZP82 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CCDC141Q6ZP82 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CCDC141Q6ZP82 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CCDC141Q6ZP82 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC141Q6ZP82 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC141Q6ZP82 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC141Q6ZP82 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC141Q6ZP82 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC141Q6ZP82 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC141Q6ZP82 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC141Q6ZP82 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC141Q6ZP82 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC141Q6ZP82 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC141Q6ZP82 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC141Q6ZP82 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CCDC141Q6ZP82 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CCDC141Q6ZP82 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CCDC141Q6ZP82 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CCDC141Q6ZP82 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CCDC141Q6ZP82 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CCDC141Q6ZP82 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CCDC141Q6ZP82 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CCDC141Q6ZP82 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CCDC141Q6ZP82 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC141Q6ZP82 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC141Q6ZP82 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC141Q6ZP82 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCDC141Q6ZP82 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCDC141Q6ZP82 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCDC141Q6ZP82 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCDC141Q6ZP82 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC141Q6ZP82 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC141Q6ZP82 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC141Q6ZP82 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CCDC141Q6ZP82 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CCDC141Q6ZP82 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
CCDC141Q6ZP82 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms