Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIS1

SLC23A3, Solute carrier family 23 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A3Q6PIS1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC23A3Q6PIS1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC23A3Q6PIS1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC23A3Q6PIS1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC23A3Q6PIS1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC23A3Q6PIS1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC23A3Q6PIS1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC23A3Q6PIS1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC23A3Q6PIS1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC23A3Q6PIS1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC23A3Q6PIS1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC23A3Q6PIS1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC23A3Q6PIS1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC23A3Q6PIS1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC23A3Q6PIS1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC23A3Q6PIS1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC23A3Q6PIS1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC23A3Q6PIS1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC23A3Q6PIS1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms