Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DUSP28Q4G0W2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DUSP28Q4G0W2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DUSP28Q4G0W2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms