Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ME3Q16798 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ME3Q16798 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ME3Q16798 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ME3Q16798 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ME3Q16798 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
ME3Q16798 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ME3Q16798 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ME3Q16798 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ME3Q16798 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ME3Q16798 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ME3Q16798 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ME3Q16798 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ME3Q16798 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ME3Q16798 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ME3Q16798 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ME3Q16798 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ME3Q16798 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ME3Q16798 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ME3Q16798 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ME3Q16798 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ME3Q16798 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ME3Q16798 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ME3Q16798 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ME3Q16798 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ME3Q16798 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ME3Q16798 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ME3Q16798 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ME3Q16798 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ME3Q16798 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ME3Q16798 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ME3Q16798 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ME3Q16798 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ME3Q16798 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ME3Q16798 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ME3Q16798 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ME3Q16798 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ME3Q16798 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ME3Q16798 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ME3Q16798 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ME3Q16798 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ME3Q16798 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ME3Q16798 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ME3Q16798 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ME3Q16798 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ME3Q16798 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ME3Q16798 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ME3Q16798 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ME3Q16798 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ME3Q16798 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ME3Q16798 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ME3Q16798 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ME3Q16798 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ME3Q16798 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ME3Q16798 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ME3Q16798 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ME3Q16798 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ME3Q16798 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ME3Q16798 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ME3Q16798 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ME3Q16798 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ME3Q16798 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ME3Q16798 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ME3Q16798 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ME3Q16798 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ME3Q16798 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ME3Q16798 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ME3Q16798 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ME3Q16798 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ME3Q16798 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ME3Q16798 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ME3Q16798 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ME3Q16798 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ME3Q16798 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ME3Q16798 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ME3Q16798 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ME3Q16798 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ME3Q16798 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ME3Q16798 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ME3Q16798 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ME3Q16798 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ME3Q16798 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ME3Q16798 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ME3Q16798 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ME3Q16798 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ME3Q16798 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ME3Q16798 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ME3Q16798 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ME3Q16798 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ME3Q16798 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ME3Q16798 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ME3Q16798 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ME3Q16798 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ME3Q16798 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ME3Q16798 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ME3Q16798 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ME3Q16798 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ME3Q16798 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ME3Q16798 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ME3Q16798 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
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