Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPAQ15257 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPAQ15257 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPAQ15257 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PTPAQ15257 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PTPAQ15257 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPAQ15257 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPAQ15257 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPAQ15257 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPAQ15257 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPAQ15257 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPAQ15257 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPAQ15257 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPAQ15257 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPAQ15257 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPAQ15257 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPAQ15257 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPAQ15257 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPAQ15257 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPAQ15257 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPAQ15257 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPAQ15257 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPAQ15257 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPAQ15257 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms