Protein–RNA interactions for Protein: Q14CS0

UBXN2B, UBX domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2BQ14CS0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN2BQ14CS0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN2BQ14CS0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN2BQ14CS0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN2BQ14CS0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN2BQ14CS0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN2BQ14CS0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN2BQ14CS0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN2BQ14CS0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN2BQ14CS0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN2BQ14CS0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN2BQ14CS0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN2BQ14CS0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBXN2BQ14CS0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBXN2BQ14CS0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBXN2BQ14CS0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN2BQ14CS0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN2BQ14CS0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN2BQ14CS0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN2BQ14CS0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN2BQ14CS0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms