Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CALCOCO2Q13137 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCOCO2Q13137 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
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