Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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NPRL3Q12980 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
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NPRL3Q12980 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPRL3Q12980 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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