Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDR2Q01850 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDR2Q01850 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDR2Q01850 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1490.5 ms