Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EFNB1P98172 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms