Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCNA1P78396 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCNA1P78396 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCNA1P78396 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCNA1P78396 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCNA1P78396 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCNA1P78396 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCNA1P78396 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCNA1P78396 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCNA1P78396 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCNA1P78396 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNA1P78396 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNA1P78396 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNA1P78396 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNA1P78396 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNA1P78396 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNA1P78396 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNA1P78396 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNA1P78396 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNA1P78396 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNA1P78396 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNA1P78396 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNA1P78396 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNA1P78396 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNA1P78396 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNA1P78396 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNA1P78396 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNA1P78396 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNA1P78396 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNA1P78396 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms