Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNTNAP1P78357 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNTNAP1P78357 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNTNAP1P78357 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNTNAP1P78357 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNTNAP1P78357 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNTNAP1P78357 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CNTNAP1P78357 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNTNAP1P78357 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNTNAP1P78357 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNTNAP1P78357 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNTNAP1P78357 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CNTNAP1P78357 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNTNAP1P78357 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNTNAP1P78357 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNTNAP1P78357 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNTNAP1P78357 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNTNAP1P78357 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNTNAP1P78357 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CNTNAP1P78357 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNTNAP1P78357 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CNTNAP1P78357 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CNTNAP1P78357 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNTNAP1P78357 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNTNAP1P78357 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNTNAP1P78357 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNTNAP1P78357 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNTNAP1P78357 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms