Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERVK_113P63132 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113P63132 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms