Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPZ1P61923 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPZ1P61923 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms