Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HERV-K104P61576 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERV-K104P61576 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERV-K104P61576 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERV-K104P61576 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERV-K104P61576 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERV-K104P61576 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERV-K104P61576 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERV-K104P61576 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
HERV-K104P61576 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERV-K104P61576 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HERV-K104P61576 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HERV-K104P61576 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HERV-K104P61576 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERV-K104P61576 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERV-K104P61576 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERV-K104P61576 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERV-K104P61576 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERV-K104P61576 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERV-K104P61576 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERV-K104P61576 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERV-K104P61576 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERV-K104P61576 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERV-K104P61576 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERV-K104P61576 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERV-K104P61576 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERV-K104P61576 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERV-K104P61576 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERV-K104P61576 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERV-K104P61576 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERV-K104P61576 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERV-K104P61576 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms