Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRYBA4P53673 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms