Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF2A2P52657 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2A2P52657 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2A2P52657 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2A2P52657 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2A2P52657 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2A2P52657 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2A2P52657 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2A2P52657 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2A2P52657 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2A2P52657 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2A2P52657 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2A2P52657 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2A2P52657 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2A2P52657 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF2A2P52657 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF2A2P52657 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF2A2P52657 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF2A2P52657 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF2A2P52657 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF2A2P52657 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF2A2P52657 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF2A2P52657 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF2A2P52657 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF2A2P52657 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms