Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
RANGAP1P46060 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
RANGAP1P46060 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
RANGAP1P46060 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
RANGAP1P46060 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
RANGAP1P46060 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
RANGAP1P46060 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
RANGAP1P46060 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
RANGAP1P46060 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
RANGAP1P46060 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
RANGAP1P46060 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
RANGAP1P46060 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
RANGAP1P46060 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
RANGAP1P46060 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
RANGAP1P46060 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
RANGAP1P46060 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC38.63■■■■□ 3.77
RANGAP1P46060 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
RANGAP1P46060 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
RANGAP1P46060 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
RANGAP1P46060 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
RANGAP1P46060 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
RANGAP1P46060 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
RANGAP1P46060 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
RANGAP1P46060 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
RANGAP1P46060 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
RANGAP1P46060 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
RANGAP1P46060 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
RANGAP1P46060 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
RANGAP1P46060 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
RANGAP1P46060 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
RANGAP1P46060 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
RANGAP1P46060 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
RANGAP1P46060 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
RANGAP1P46060 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
RANGAP1P46060 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
RANGAP1P46060 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
RANGAP1P46060 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
RANGAP1P46060 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
RANGAP1P46060 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
RANGAP1P46060 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
RANGAP1P46060 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
RANGAP1P46060 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
RANGAP1P46060 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
RANGAP1P46060 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
RANGAP1P46060 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
RANGAP1P46060 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC38.56■■■■□ 3.76
RANGAP1P46060 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC38.56■■■■□ 3.76
RANGAP1P46060 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
RANGAP1P46060 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
RANGAP1P46060 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
RANGAP1P46060 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
RANGAP1P46060 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
RANGAP1P46060 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
RANGAP1P46060 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
RANGAP1P46060 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
RANGAP1P46060 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
RANGAP1P46060 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
RANGAP1P46060 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
RANGAP1P46060 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
RANGAP1P46060 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
RANGAP1P46060 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
RANGAP1P46060 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
RANGAP1P46060 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
RANGAP1P46060 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
RANGAP1P46060 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
RANGAP1P46060 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
RANGAP1P46060 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
RANGAP1P46060 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
RANGAP1P46060 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
RANGAP1P46060 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
RANGAP1P46060 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
RANGAP1P46060 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
RANGAP1P46060 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
RANGAP1P46060 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
RANGAP1P46060 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
RANGAP1P46060 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
RANGAP1P46060 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
RANGAP1P46060 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
RANGAP1P46060 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
RANGAP1P46060 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
RANGAP1P46060 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
RANGAP1P46060 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
RANGAP1P46060 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
RANGAP1P46060 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC38.48■■■■□ 3.75
RANGAP1P46060 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
RANGAP1P46060 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
RANGAP1P46060 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
RANGAP1P46060 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
RANGAP1P46060 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
RANGAP1P46060 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
RANGAP1P46060 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
RANGAP1P46060 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
RANGAP1P46060 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
RANGAP1P46060 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
RANGAP1P46060 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.74
RANGAP1P46060 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC38.45■■■■□ 3.74
RANGAP1P46060 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
RANGAP1P46060 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
RANGAP1P46060 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
RANGAP1P46060 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms