Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX11P35716 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX11P35716 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX11P35716 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX11P35716 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX11P35716 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX11P35716 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX11P35716 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX11P35716 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX11P35716 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX11P35716 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX11P35716 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX11P35716 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX11P35716 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX11P35716 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX11P35716 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX11P35716 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX11P35716 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX11P35716 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX11P35716 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX11P35716 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX11P35716 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX11P35716 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX11P35716 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX11P35716 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX11P35716 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX11P35716 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX11P35716 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX11P35716 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX11P35716 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX11P35716 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX11P35716 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX11P35716 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX11P35716 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX11P35716 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX11P35716 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX11P35716 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX11P35716 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX11P35716 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOX11P35716 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOX11P35716 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOX11P35716 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOX11P35716 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOX11P35716 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SOX11P35716 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SOX11P35716 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOX11P35716 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SOX11P35716 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOX11P35716 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX11P35716 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX11P35716 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX11P35716 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX11P35716 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX11P35716 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX11P35716 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX11P35716 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX11P35716 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX11P35716 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX11P35716 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX11P35716 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX11P35716 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX11P35716 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX11P35716 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX11P35716 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX11P35716 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX11P35716 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX11P35716 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX11P35716 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX11P35716 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX11P35716 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX11P35716 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX11P35716 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX11P35716 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX11P35716 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX11P35716 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX11P35716 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX11P35716 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX11P35716 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SOX11P35716 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX11P35716 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX11P35716 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX11P35716 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX11P35716 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX11P35716 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX11P35716 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX11P35716 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX11P35716 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX11P35716 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX11P35716 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX11P35716 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX11P35716 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX11P35716 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX11P35716 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX11P35716 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX11P35716 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX11P35716 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX11P35716 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX11P35716 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX11P35716 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX11P35716 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms