Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPA3P35244 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPA3P35244 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPA3P35244 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPA3P35244 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPA3P35244 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPA3P35244 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPA3P35244 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPA3P35244 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPA3P35244 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPA3P35244 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPA3P35244 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPA3P35244 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPA3P35244 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPA3P35244 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPA3P35244 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPA3P35244 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPA3P35244 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPA3P35244 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPA3P35244 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPA3P35244 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPA3P35244 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPA3P35244 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPA3P35244 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPA3P35244 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPA3P35244 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPA3P35244 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPA3P35244 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPA3P35244 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPA3P35244 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPA3P35244 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RPA3P35244 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPA3P35244 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPA3P35244 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPA3P35244 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPA3P35244 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPA3P35244 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPA3P35244 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPA3P35244 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPA3P35244 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPA3P35244 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPA3P35244 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPA3P35244 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPA3P35244 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPA3P35244 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPA3P35244 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPA3P35244 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPA3P35244 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPA3P35244 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPA3P35244 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPA3P35244 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPA3P35244 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPA3P35244 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPA3P35244 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RPA3P35244 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPA3P35244 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPA3P35244 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPA3P35244 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RPA3P35244 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPA3P35244 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPA3P35244 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPA3P35244 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPA3P35244 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPA3P35244 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPA3P35244 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPA3P35244 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPA3P35244 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPA3P35244 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPA3P35244 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPA3P35244 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RPA3P35244 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPA3P35244 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPA3P35244 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPA3P35244 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RPA3P35244 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPA3P35244 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPA3P35244 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPA3P35244 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPA3P35244 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPA3P35244 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPA3P35244 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPA3P35244 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPA3P35244 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPA3P35244 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPA3P35244 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPA3P35244 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPA3P35244 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPA3P35244 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPA3P35244 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPA3P35244 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPA3P35244 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPA3P35244 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPA3P35244 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPA3P35244 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPA3P35244 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPA3P35244 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPA3P35244 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPA3P35244 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPA3P35244 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPA3P35244 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms