Protein–RNA interactions for Protein: P34096

RNASE4, Ribonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASE4P34096 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNASE4P34096 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNASE4P34096 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNASE4P34096 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNASE4P34096 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNASE4P34096 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNASE4P34096 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RNASE4P34096 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNASE4P34096 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNASE4P34096 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNASE4P34096 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RNASE4P34096 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNASE4P34096 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNASE4P34096 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNASE4P34096 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RNASE4P34096 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RNASE4P34096 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RNASE4P34096 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RNASE4P34096 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RNASE4P34096 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RNASE4P34096 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RNASE4P34096 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RNASE4P34096 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RNASE4P34096 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms