Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HOXA10P31260 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HOXA10P31260 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
HOXA10P31260 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
HOXA10P31260 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HOXA10P31260 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HOXA10P31260 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXA10P31260 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXA10P31260 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXA10P31260 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXA10P31260 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXA10P31260 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXA10P31260 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXA10P31260 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXA10P31260 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXA10P31260 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXA10P31260 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXA10P31260 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXA10P31260 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXA10P31260 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXA10P31260 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXA10P31260 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXA10P31260 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXA10P31260 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXA10P31260 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXA10P31260 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXA10P31260 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXA10P31260 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXA10P31260 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXA10P31260 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HOXA10P31260 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HOXA10P31260 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms