Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCND3P30281 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCND3P30281 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCND3P30281 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCND3P30281 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCND3P30281 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCND3P30281 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCND3P30281 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCND3P30281 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCND3P30281 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCND3P30281 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCND3P30281 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCND3P30281 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCND3P30281 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCND3P30281 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCND3P30281 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCND3P30281 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCND3P30281 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCND3P30281 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCND3P30281 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCND3P30281 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCND3P30281 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCND3P30281 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCND3P30281 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCND3P30281 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCND3P30281 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCND3P30281 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CCND3P30281 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCND3P30281 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCND3P30281 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCND3P30281 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCND3P30281 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCND3P30281 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCND3P30281 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCND3P30281 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCND3P30281 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCND3P30281 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCND3P30281 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCND3P30281 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCND3P30281 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCND3P30281 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCND3P30281 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCND3P30281 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCND3P30281 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCND3P30281 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCND3P30281 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCND3P30281 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCND3P30281 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCND3P30281 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCND3P30281 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CCND3P30281 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CCND3P30281 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCND3P30281 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCND3P30281 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCND3P30281 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCND3P30281 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCND3P30281 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCND3P30281 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCND3P30281 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCND3P30281 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCND3P30281 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCND3P30281 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCND3P30281 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCND3P30281 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCND3P30281 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCND3P30281 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCND3P30281 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCND3P30281 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCND3P30281 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCND3P30281 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCND3P30281 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCND3P30281 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCND3P30281 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCND3P30281 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCND3P30281 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCND3P30281 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCND3P30281 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCND3P30281 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCND3P30281 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCND3P30281 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCND3P30281 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCND3P30281 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCND3P30281 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCND3P30281 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCND3P30281 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCND3P30281 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCND3P30281 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCND3P30281 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCND3P30281 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCND3P30281 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCND3P30281 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCND3P30281 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCND3P30281 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCND3P30281 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCND3P30281 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCND3P30281 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCND3P30281 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCND3P30281 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCND3P30281 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCND3P30281 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms