Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTGFP29279 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTGFP29279 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTGFP29279 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CTGFP29279 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CTGFP29279 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CTGFP29279 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CTGFP29279 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CTGFP29279 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CTGFP29279 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTGFP29279 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTGFP29279 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CTGFP29279 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CTGFP29279 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CTGFP29279 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTGFP29279 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CTGFP29279 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTGFP29279 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CTGFP29279 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTGFP29279 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CTGFP29279 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CTGFP29279 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CTGFP29279 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTGFP29279 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTGFP29279 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTGFP29279 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTGFP29279 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTGFP29279 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTGFP29279 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTGFP29279 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTGFP29279 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTGFP29279 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CTGFP29279 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CTGFP29279 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTGFP29279 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTGFP29279 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTGFP29279 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTGFP29279 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTGFP29279 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CTGFP29279 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTGFP29279 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTGFP29279 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTGFP29279 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTGFP29279 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTGFP29279 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTGFP29279 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTGFP29279 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CTGFP29279 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTGFP29279 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CTGFP29279 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CTGFP29279 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTGFP29279 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTGFP29279 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CTGFP29279 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTGFP29279 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTGFP29279 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTGFP29279 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTGFP29279 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CTGFP29279 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CTGFP29279 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTGFP29279 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTGFP29279 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTGFP29279 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTGFP29279 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTGFP29279 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTGFP29279 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTGFP29279 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTGFP29279 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTGFP29279 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTGFP29279 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTGFP29279 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CTGFP29279 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTGFP29279 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CTGFP29279 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTGFP29279 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTGFP29279 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTGFP29279 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTGFP29279 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTGFP29279 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTGFP29279 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTGFP29279 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTGFP29279 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTGFP29279 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTGFP29279 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTGFP29279 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTGFP29279 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CTGFP29279 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTGFP29279 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTGFP29279 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTGFP29279 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTGFP29279 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTGFP29279 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTGFP29279 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTGFP29279 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTGFP29279 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTGFP29279 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTGFP29279 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTGFP29279 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTGFP29279 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTGFP29279 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms