Protein–RNA interactions for Protein: P17035

ZNF28, Zinc finger protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF28P17035 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF28P17035 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF28P17035 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms