Protein–RNA interactions for Protein: P00846

MT-ATP6, ATP synthase subunit a, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ATP6P00846 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MT-ATP6P00846 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MT-ATP6P00846 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MT-ATP6P00846 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MT-ATP6P00846 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MT-ATP6P00846 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MT-ATP6P00846 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MT-ATP6P00846 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MT-ATP6P00846 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MT-ATP6P00846 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MT-ATP6P00846 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MT-ATP6P00846 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MT-ATP6P00846 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MT-ATP6P00846 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MT-ATP6P00846 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MT-ATP6P00846 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MT-ATP6P00846 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MT-ATP6P00846 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MT-ATP6P00846 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MT-ATP6P00846 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MT-ATP6P00846 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MT-ATP6P00846 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MT-ATP6P00846 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MT-ATP6P00846 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MT-ATP6P00846 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MT-ATP6P00846 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MT-ATP6P00846 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MT-ATP6P00846 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MT-ATP6P00846 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MT-ATP6P00846 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MT-ATP6P00846 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MT-ATP6P00846 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MT-ATP6P00846 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MT-ATP6P00846 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MT-ATP6P00846 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MT-ATP6P00846 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MT-ATP6P00846 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MT-ATP6P00846 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MT-ATP6P00846 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MT-ATP6P00846 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MT-ATP6P00846 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MT-ATP6P00846 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MT-ATP6P00846 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MT-ATP6P00846 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MT-ATP6P00846 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MT-ATP6P00846 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MT-ATP6P00846 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MT-ATP6P00846 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MT-ATP6P00846 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MT-ATP6P00846 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms