Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM4AO75164 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM4AO75164 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms