Protein–RNA interactions for Protein: O60245

PCDH7, Protocadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH7O60245 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH7O60245 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms