Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DHX16O60231 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DHX16O60231 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DHX16O60231 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DHX16O60231 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DHX16O60231 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DHX16O60231 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DHX16O60231 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DHX16O60231 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DHX16O60231 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DHX16O60231 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DHX16O60231 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DHX16O60231 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DHX16O60231 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DHX16O60231 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DHX16O60231 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
DHX16O60231 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DHX16O60231 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DHX16O60231 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DHX16O60231 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DHX16O60231 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DHX16O60231 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
DHX16O60231 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DHX16O60231 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DHX16O60231 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DHX16O60231 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DHX16O60231 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
DHX16O60231 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DHX16O60231 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
DHX16O60231 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DHX16O60231 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DHX16O60231 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DHX16O60231 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DHX16O60231 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DHX16O60231 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DHX16O60231 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DHX16O60231 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DHX16O60231 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DHX16O60231 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DHX16O60231 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DHX16O60231 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DHX16O60231 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DHX16O60231 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DHX16O60231 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DHX16O60231 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DHX16O60231 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DHX16O60231 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DHX16O60231 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DHX16O60231 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DHX16O60231 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DHX16O60231 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DHX16O60231 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DHX16O60231 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DHX16O60231 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DHX16O60231 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DHX16O60231 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DHX16O60231 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DHX16O60231 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DHX16O60231 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
DHX16O60231 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DHX16O60231 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DHX16O60231 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DHX16O60231 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DHX16O60231 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DHX16O60231 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DHX16O60231 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DHX16O60231 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DHX16O60231 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DHX16O60231 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DHX16O60231 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DHX16O60231 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DHX16O60231 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DHX16O60231 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DHX16O60231 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DHX16O60231 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DHX16O60231 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DHX16O60231 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DHX16O60231 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DHX16O60231 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DHX16O60231 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DHX16O60231 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DHX16O60231 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DHX16O60231 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DHX16O60231 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DHX16O60231 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
DHX16O60231 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DHX16O60231 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DHX16O60231 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DHX16O60231 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DHX16O60231 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DHX16O60231 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DHX16O60231 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DHX16O60231 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DHX16O60231 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX16O60231 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX16O60231 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX16O60231 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX16O60231 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DHX16O60231 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DHX16O60231 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms