Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENRO43583 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENRO43583 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENRO43583 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENRO43583 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENRO43583 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENRO43583 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENRO43583 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENRO43583 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENRO43583 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENRO43583 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENRO43583 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENRO43583 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENRO43583 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENRO43583 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENRO43583 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENRO43583 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENRO43583 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENRO43583 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENRO43583 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENRO43583 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENRO43583 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENRO43583 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENRO43583 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENRO43583 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENRO43583 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENRO43583 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DENRO43583 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DENRO43583 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
DENRO43583 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DENRO43583 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENRO43583 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENRO43583 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENRO43583 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENRO43583 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENRO43583 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENRO43583 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENRO43583 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENRO43583 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENRO43583 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENRO43583 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DENRO43583 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENRO43583 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENRO43583 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENRO43583 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DENRO43583 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENRO43583 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENRO43583 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DENRO43583 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENRO43583 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENRO43583 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENRO43583 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENRO43583 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENRO43583 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENRO43583 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENRO43583 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENRO43583 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENRO43583 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DENRO43583 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENRO43583 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENRO43583 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DENRO43583 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DENRO43583 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DENRO43583 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENRO43583 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENRO43583 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENRO43583 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENRO43583 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENRO43583 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENRO43583 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENRO43583 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENRO43583 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENRO43583 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENRO43583 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENRO43583 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENRO43583 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENRO43583 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DENRO43583 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENRO43583 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENRO43583 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DENRO43583 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENRO43583 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENRO43583 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENRO43583 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENRO43583 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENRO43583 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DENRO43583 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENRO43583 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENRO43583 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENRO43583 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENRO43583 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENRO43583 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENRO43583 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENRO43583 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENRO43583 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENRO43583 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENRO43583 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENRO43583 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENRO43583 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENRO43583 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms