Protein–RNA interactions for Protein: O43435

TBX1, T-box transcription factor TBX1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX1O43435 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBX1O43435 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBX1O43435 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBX1O43435 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBX1O43435 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBX1O43435 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBX1O43435 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBX1O43435 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBX1O43435 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBX1O43435 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBX1O43435 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBX1O43435 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBX1O43435 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBX1O43435 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TBX1O43435 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TBX1O43435 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBX1O43435 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBX1O43435 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBX1O43435 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBX1O43435 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBX1O43435 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBX1O43435 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBX1O43435 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TBX1O43435 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBX1O43435 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBX1O43435 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBX1O43435 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBX1O43435 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBX1O43435 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBX1O43435 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBX1O43435 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBX1O43435 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBX1O43435 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBX1O43435 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBX1O43435 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBX1O43435 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBX1O43435 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBX1O43435 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TBX1O43435 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBX1O43435 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBX1O43435 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBX1O43435 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBX1O43435 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBX1O43435 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBX1O43435 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBX1O43435 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBX1O43435 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBX1O43435 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBX1O43435 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TBX1O43435 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBX1O43435 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBX1O43435 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBX1O43435 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBX1O43435 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBX1O43435 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBX1O43435 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBX1O43435 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBX1O43435 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBX1O43435 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBX1O43435 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBX1O43435 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TBX1O43435 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBX1O43435 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBX1O43435 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBX1O43435 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBX1O43435 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBX1O43435 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBX1O43435 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBX1O43435 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBX1O43435 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBX1O43435 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBX1O43435 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBX1O43435 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TBX1O43435 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TBX1O43435 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TBX1O43435 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TBX1O43435 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBX1O43435 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBX1O43435 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBX1O43435 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBX1O43435 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBX1O43435 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBX1O43435 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBX1O43435 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBX1O43435 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBX1O43435 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBX1O43435 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBX1O43435 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBX1O43435 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBX1O43435 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBX1O43435 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBX1O43435 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBX1O43435 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBX1O43435 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBX1O43435 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBX1O43435 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBX1O43435 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBX1O43435 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TBX1O43435 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TBX1O43435 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms